## 简介
随着大数据时代的到来,数据在我们的生活中扮演着越来越重要的角色,如何从大数据中寻找事物之间的规律,如何用图形展示出事物之间的规律成为数据分析工作者需要不断思考的问题。在个教程中主要是针对生物医学测序数据或临床数据进行可视化展示进行叙述,希望能够通过这份教程对自己所学做一个总结,同时也希望同更多的人探讨生物医学大数据分析工作。
当我能够通过一个美观的图表展示出数据特征和数据信息时,我内心是十分有成就感的,这也是我不断学习新方法新技术的一个动力,希望我可以继续保持这一份热情。
本教程里面大部分方法不是本人原创,都是从前辈那里学习而加以运用,因此,十分感谢那些原创的前辈以及分享给我们技术和方法的前辈,在此如果有侵犯个人权益的,还希望能够提醒删除相应内容。
- 智汇医圈
- 第一章 前言
- 1.1 简介
- 1.2 制作该教程的目的
- 1.3 学习该教程需要掌握的基础知识
- 1.4 该教程适用人群
- 第二章 散点图(scatter plot)
- 2.1 基本的散点图
- 2.2 3D 散点图
- 第三章 线图(line plot)
- 3.1 基本的线图
- 第四章 箱型图(boxplot)
- 4.1 基本的箱型图
- 4.2 图形参数调整
- 4.3 多分组箱型图
- 4.4 小提琴图
- 第五章 密度图(density plot)
- 5.1 基本的密度图
- 第六章 热图(Heatmap)
- 6.1 基本的热图
- 6.2 ggplot2 heatmap
- 6.3 相关性热图
- 第七章 主成分分析(PCA)
- 7.1 2D PCA
- 7.2 3D PCA
- 第八章 ROC 曲线
- 8.1 基本的 ROC 曲线
- 第九章 生存分析(KM plot)
- 9.1 基本的生存分析
- 第十章 KEGG 和 GO 分析
- 10.1 KEGG 分析
- 10.2 GO 分析
- 第十一章 Circular plot
- 11.1 基本的 Circular plot
- 附录 下载数据