## 学习本教程需要的基本知识
本教程提供实例数据,方便学习者能够快速重复出同样的结果,尽量做到简单化和实用化,但是建议学习者掌握R的基本理论知识,因为就像看英语一样,你最好知道每句话都是什么意思,这样运用的时候才可以知道对错,后续才可以恰当的运用到自己的项目当中。
> <font color=grey size=15>本教程主要分析的数据为测序数据,所有的实例数据都在自愈TCGA数据库,更加贴近实际讲述如何分析TCGA里面的>测序数据,希望能够给分析TCGA数据的小伙伴们一点提示,同时也希望大家一起相互学习。</font>
- 智汇医圈
- 第一章 前言
- 1.1 简介
- 1.2 制作该教程的目的
- 1.3 学习该教程需要掌握的基础知识
- 1.4 该教程适用人群
- 第二章 散点图(scatter plot)
- 2.1 基本的散点图
- 2.2 3D 散点图
- 第三章 线图(line plot)
- 3.1 基本的线图
- 第四章 箱型图(boxplot)
- 4.1 基本的箱型图
- 4.2 图形参数调整
- 4.3 多分组箱型图
- 4.4 小提琴图
- 第五章 密度图(density plot)
- 5.1 基本的密度图
- 第六章 热图(Heatmap)
- 6.1 基本的热图
- 6.2 ggplot2 heatmap
- 6.3 相关性热图
- 第七章 主成分分析(PCA)
- 7.1 2D PCA
- 7.2 3D PCA
- 第八章 ROC 曲线
- 8.1 基本的 ROC 曲线
- 第九章 生存分析(KM plot)
- 9.1 基本的生存分析
- 第十章 KEGG 和 GO 分析
- 10.1 KEGG 分析
- 10.2 GO 分析
- 第十一章 Circular plot
- 11.1 基本的 Circular plot
- 附录 下载数据