# 一、数据科学的生命周期
> 原文:[DS-100/textbook/notebooks/ch01](https://nbviewer.jupyter.org/github/DS-100/textbook/tree/master/notebooks/ch01/)
>
> 校验:[飞龙](https://github.com/wizardforcel)
>
> 自豪地采用[谷歌翻译](https://translate.google.cn/)
在数据科学中,我们使用大量不同的数据集来对世界做出结论。在这个课程中,我们将通过计算和推理思维的双重视角,来讨论数据科学的关键原理和技术。实际上,这涉及以下过程:
+ 提出一个问题
+ 获取和清理数据
+ 进行探索性数据分析
+ 用预测和推理得出结论
在这个过程的最后一步之后,通常出现更多的问题,因此我们可以反复地执行这个过程,来发现我们的世界的新特征。这个正反馈的循环对我们的工作至关重要,我们称之为数据科学生命周期。
如果数据科学的生命周期与它说的一样容易进行,那么就不需要该主题的教科书了。幸运的是,生命周期中的每个步骤都包含众多挑战,这些挑战揭示了强大和通常令人惊讶的见解,它们构成了使用数据在思考后进行决策的基础。
和 Data8 一样,我们将以一个例子开始。
> 译者注:Data8 是 DS100 是先修课。我之前翻译了它的课本,[《计算与推断思维 中文版》](https://github.com/Kivy-CN/data8-textbook-zh)。
## 关于本书
在我们继续之前,重要的是说出我们对读者的假设。
在本书中,我们将当作你已经上完了 Data8 或者其他一些类似的东西。 特别是,我们假定你对以下主题有一定了解(同时给出 Data8 课本的页面链接)。
+ [表格数据处理:选择,过滤,分组,连接](https://github.com/Kivy-CN/data8-textbook-zh/blob/master/5.md)
+ [抽样,统计的经验分布](https://github.com/Kivy-CN/data8-textbook-zh/blob/master/9.md)
+ [使用自举重采样的假设检验](https://github.com/Kivy-CN/data8-textbook-zh/blob/master/10.md)
+ [最小二乘回归和回归推断](https://github.com/Kivy-CN/data8-textbook-zh/blob/master/14.md)
+ [分类](https://github.com/Kivy-CN/data8-textbook-zh/blob/master/15.md)
另外,我们假设你已经上完了 CS61A 或者其他类似的东西,因此除了特殊情况外,不会解释 Python 的语法。
> 译者注:CS61A(SICP Python)是计算机科学的第一门课,中文版讲义请见[《SICP Python 中文版》](https://github.com/Kivy-CN/sicp-py-zh)。
## DS100 的学生
回想一下,数据科学生命周期涉及以下大致的步骤:
+ 问题表述:
+ 我们想知道什么,或者我们想要解决什么问题?
+ 我们的假设是什么?
+ 我们的成功指标是什么?
+ 数据采集和清洗:
+ 我们有什么数据以及需要哪些数据?
+ 我们将如何收集更多数据?
+ 我们如何组织数据来分析?
+ 探索性数据分析:
+ 我们是否有了相关数据?
+ 数据有哪些偏差,异常或其他问题?
+ 我们如何转换数据来实现有效的分析?
+ 预测和推断:
+ 这些数据说了世界的什么事情?
+ 它回答我们的问题,还是准确地解决问题?
+ 我们的结论有多健壮?
### 问题表述
我们想知道 DS100 中的学生姓名的数据,是否向我们提供了学生本身的其他信息。 虽然这是一个模糊的问题,但这足以让我们处理我们的数据,我们当然可以在问题变得更加精确的时候提出问题。
### 数据采集和清洗
在 DS100 中,我们将研究收集数据的各种方法。
我们首先看看我们的数据,这是我们从以前的 DS100 课程中下载的学生姓名的名单。
如果你现在不了解代码,请不要担心;我们稍后会更深入地介绍这些库。 相反,请关注我们展示的流程和图表。
```py
import pandas as pd
students = pd.read_csv('roster.csv')
students
```
| | Name | Role |
| --- | --- | --- |
| 0 | Keeley | Student |
| 1 | John | Student |
| 2 | BRYAN | Student |
| ... | ... | ... |
| 276 | Ernesto | Waitlist Student |
| 277 | Athan | Waitlist Student |
| 278 | Michael | Waitlist Student |
279 行 × 2 列
我们很快可以看到,数据中有一些奇怪的东西。 例如,其中一个学生的姓名全部是大写字母。 另外,`Role`列的作用并不明显。
在 DS100 中,我们将研究如何识别数据中的异常并执行修正。 大写字母的差异将导致我们的程序认为`'BRYAN'`和`'Bryan'`是不同的名称,但他们对于我们的目标是相同的。 我们将所有名称转换为小写来避免这种情况。
```py
students['Name'] = students['Name'].str.lower()
students
```
| | Name | Role |
| --- | --- | --- |
| 0 | keeley | Student |
| 1 | john | Student |
| 2 | bryan | Student |
| ... | ... | ... |
| 276 | ernesto | Waitlist Student |
| 277 | athan | Waitlist Student |
| 278 | michael | Waitlist Student |
279 行 × 2 列
现在我们的数据有了更容易处理的格式,我们继续进行探索性数据分析。
## 探索性数据分析(EDA)
术语探索性数据分析(简称 EDA)是指发现我们的数据特征的过程,这些特征为未来的分析提供信息。
这是上一页的`students`表:
```py
students
```
| | Name | Role |
| --- | --- | --- |
| 0 | keeley | Student |
| 1 | john | Student |
| 2 | bryan | Student |
| ... | ... | ... |
| 276 | ernesto | Waitlist Student |
| 277 | athan | Waitlist Student |
| 278 | michael | Waitlist Student |
279 行 × 2 列
我们留下了许多问题。 这个名单中有多少名学生? `Role`列是什么意思? 我们进行 EDA 来更全面地了解我们的数据。
在 DS100 中,我们将研究探索性数据分析和实践,来分析新数据集。
通常,我们通过重复提出简单问题,他们有关我们想知道的数据,来探索数据。 我们将以这种方式构建我们的分析。
我们的数据集中有多少学生?
```py
print("There are", len(students), "students on the roster.")
# There are 279 students on the roster.
```
一个自然的后续问题是,这是否是完整的学生名单。 在这种情况下,我们碰巧知道这个列表包含班级中的所有学生。
`Role`字段的含义是什么?
理解字段的含义,通常可以通过查看字段数据的唯一值来实现:
```py
students['Role'].value_counts().to_frame()
```
| | Role |
| --- | --- |
| Student | 237 |
| Waitlist Student | 42 |
我们可以在这里看到,我们的数据不仅包含当时注册了课程的学生,还包含等候名单上的学生。 `Role`列告诉我们每个学生是否注册。
那名称呢? 我们如何总结这个字段?
在 DS100 中,我们将处理许多不同类型的数据(不仅仅是数字),而且我们将研究面向不同类型的数据的技术。
好的起点可能是检查字符串的长度。
```py
sns.distplot(students['Name'].str.len(), rug=True, axlabel="Number of Characters")
# <matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x10e6fd0b8>
```
![](https://img.kancloud.cn/c4/85/c485e283dea8093ef79cdbce91a71445_379x270.png)
这种可视化向我们展示了,大多数名称的长度在 3 到 9 个字符之间。 这给了我们一个机会,来检查我们的数据是否合理 - 如果有很多名称长度为 1 个字符,我们就有充分的理由重新检查我们的数据。
### 名称里面有什么?
虽然这个数据集非常简单,但我们很快就会看到,仅仅是名称就可以揭示我们班级的相当多的信息。
## 名称里面有什么
到目前为止,我们已经对我们的数据提出了一个大致的问题:“DS100 中的学生名称是否告诉我们该课程的任何信息?”
通过将所有名称转换为小写字母,我们完成一些数据清理工作。 在我们的探索性数据分析过程中,我们发现,我们的名单包含班级和候补名单中的大约 270 个学生姓名,而大部分名称长度在 4 到 8 个字符之间。
根据名称,我们还能发现班级的什么其他信息? 我们可能会考虑数据集中的单个名称:
```py
students['Name'][5]
# 'jerry'
```
从这个名称中我们可以推断出,这个学生可能是一个男生。我们也可以猜测学生的年龄。例如,如果我们知道,杰里在 1998 年是一个非常受欢迎的婴儿名称,那么我们可能会猜测这个学生大约二十岁。
这个想法给了我们两个需要调查的新问题:
+ “DS100 中的学生名称,是否告诉了我们课堂上的性别分布?”
+ “DS100 中的第一批学生,是否告诉了我们课堂上的年龄分布?”
为了调查这些问题,我们需要一个数据集,它将姓名与性别和年份相关联。方便的是,美国社会保障部门在线提供这样一个数据集:<https://www.ssa.gov/oact/babynames/index.html>。他们的数据集记录了婴儿出生时的名称,因此通常称为婴儿名称数据集。
我们将从下载开始,然后将数据集加载到 Python 中。再次,不要担心理解第一章中的代码。理解整个过程更重要。
```py
import urllib.request
import os.path
data_url = "https://www.ssa.gov/oact/babynames/names.zip"
local_filename = "babynames.zip"
if not os.path.exists(local_filename): # if the data exists don't download again
with urllib.request.urlopen(data_url) as resp, open(local_filename, 'wb') as f:
f.write(resp.read())
import zipfile
babynames = []
with zipfile.ZipFile(local_filename, "r") as zf:
data_files = [f for f in zf.filelist if f.filename[-3:] == "txt"]
def extract_year_from_filename(fn):
return int(fn[3:7])
for f in data_files:
year = extract_year_from_filename(f.filename)
with zf.open(f) as fp:
df = pd.read_csv(fp, names=["Name", "Sex", "Count"])
df["Year"] = year
babynames.append(df)
babynames = pd.concat(babynames)
babynames
```
| | Name | Sex | Count | Year |
| --- | --- | --- | --- | --- |
| 0 | Mary | F | 9217 | 1884 |
| 1 | Anna | F | 3860 | 1884 |
| 2 | Emma | F | 2587 | 1884 |
| ... | ... | ... | ... | ... |
| 2081 | Verna | M | 5 | 1883 |
| 2082 | Winnie | M | 5 | 1883 |
| 2083 | Winthrop | M | 5 | 1883 |
1891894 行 × 4 列
```
ls -alh babynames.csv
# -rw-r--r-- 1 sam staff 30M Jan 22 15:31 babynames.csv
```
看起来,数据集包含名称,婴儿性别,具有该名称的婴儿数量以及这些婴儿的出生年份。 为了确认,我们从检查来自 SSN 的数据集描述:<https://www.ssa.gov/oact/babynames/background.html>。
> 所有名称均来自 1879 年后美国出生人口的社保卡申请。请注意,很多 1937 年以前出生的人从未申请过社保卡,所以他们的名字不包含在我们的数据中。 对于其他申请人,我们的记录可能不会显示出生地点,并且他们的姓名也不会包含在我们的数据中。
>
> 所有数据均来自截至我们的 2017 年 3 月社保卡申请记录的 100% 样本。
这个数据的一个有用的可视化,是绘制每年出生的男性和女性婴儿的数量:
```py
pivot_year_name_count = pd.pivot_table(
babynames, index='Year', columns='Sex',
values='Count', aggfunc=np.sum)
pink_blue = ["#E188DB", "#334FFF"]
with sns.color_palette(sns.color_palette(pink_blue)):
pivot_year_name_count.plot(marker=".")
plt.title("Registered Names vs Year Stratified by Sex")
plt.ylabel('Names Registered that Year')
```
![](https://img.kancloud.cn/e8/94/e89458fce83ea10c1d953f4ece1290fe_435x289.png)
这个绘图让我们质疑,1880 年的美国是否有婴儿。上面引用的一句话有助于解释:
> 请注意,很多 1937 年以前出生的人从未申请过社保卡,所以他们的名字不包含在我们的数据中。 对于其他申请人,我们的记录可能不会显示出生地点,并且他们的姓名也不会包含在我们的数据中。
我们还可以在上图中清楚地看到婴儿潮的时期。
### 从名字推断性别
我们使用这个数据集来估计我们班的男女生人数。 与我们班的名单一样,我们先将名称小写:
```py
babynames['Name'] = babynames['Name'].str.lower()
babynames
```
| | Name | Sex | Count | Year |
| --- | --- | --- | --- | --- |
| 0 | mary | F | 9217 | 1884 |
| 1 | anna | F | 3860 | 1884 |
| 2 | emma | F | 2587 | 1884 |
| ... | ... | ... | ... | ... |
| 2081 | verna | M | 5 | 1883 |
| 2082 | winnie | M | 5 | 1883 |
| 2083 | winthrop | M | 5 | 1883 |
1891894 行 × 4 列
然后,我们计算对于每个名字,共有多少个男婴和女婴出生:
```py
sex_counts = pd.pivot_table(babynames, index='Name', columns='Sex', values='Count',
aggfunc='sum', fill_value=0., margins=True)
sex_counts
```
| Sex | F | M | All |
| ---| --- | --- | --- |
| Name | | | |
| aaban | 0 | 96 | 96 |
| aabha | 35 | 0 | 35 |
| aabid | 0 | 10 | 10 |
| ... | ... | ... | ... |
| zyyon | 0 | 6 | 6 |
| zzyzx | 0 | 5 | 5 |
| All | 170639571 | 173894326 | 344533897 |
96175 行 × 3 列
为了决定一个名字是男性还是女性,我们可以计算出这个名字给女性婴儿的次数比例。
```py
prop_female = sex_counts['F'] / sex_counts['All']
sex_counts['prop_female'] = prop_female
sex_counts
```
| Sex | F | M | All | prop_female |
| ---| --- | --- | --- | --- |
| Name | | | | |
| aaban | 0 | 96 | 96 | 0.000000 |
| aabha | 35 | 0 | 35 | 1.000000 |
| aabid | 0 | 10 | 10 | 0.000000 |
| ... | ... | ... | ... | ... |
| zyyon | 0 | 6 | 6 | 0.000000 |
| zzyzx | 0 | 5 | 5 | 0.000000 |
| All | 170639571 | 173894326 | 344533897 | 0.495277 |
96175 行 × 4 列
然后,我们可以定义一个函数,查找给定名称的女性比例。
```py
def sex_from_name(name):
if name in sex_counts.index:
prop = sex_counts.loc[name, 'prop_female']
return 'F' if prop > 0.5 else 'M'
else:
return None
sex_from_name('sam')
# 'M'
```
尝试在这个框中输入一些名称,来查看这个函数是否输出你期望的内容:
```py
interact(sex_from_name, name='sam');
```
我们在班级名单中,使用最可能的性别标记每个名称。
```py
students['sex'] = students['Name'].apply(sex_from_name)
students
```
| | Name | Role | sex |
| --- | --- | --- | --- |
| 0 | keeley | Student | F |
| 1 | john | Student | M |
| 2 | bryan | Student | M |
| ... | ... | ... | ... |
| 276 | ernesto | Waitlist Student | M |
| 277 | athan | Waitlist Student | M |
| 278 | michael | Waitlist Student | M |
279 行 × 3 列
现在,估计我们有多少男女学生就很容易了:
```py
students['sex'].value_counts()
'''
M 144
F 92
Name: sex, dtype: int64
'''
```
### 从名称推断年龄
我们可以采用类似的方法来估计班级的年龄分布,将每个姓名映射到数据集中的平均年龄。
```py
def avg_year(group):
return np.average(group['Year'], weights=group['Count'])
avg_years = (
babynames
.groupby('Name')
.apply(avg_year)
.rename('avg_year')
.to_frame()
)
avg_years
```
| | avg_year |
| --- | --- |
| Name | |
| aaban | 2012.572917 |
| aabha | 2013.714286 |
| aabid | 2009.500000 |
| ... | ... |
| zyyanna | 2010.000000 |
| zyyon | 2014.000000 |
| zzyzx | 2010.000000 |
96174 行 × 1 列
```py
def year_from_name(name):
return (avg_years.loc[name, 'avg_year']
if name in avg_years.index
else None)
# Generate input box for you to try some names out:
interact(year_from_name, name='fernando');
students['year'] = students['Name'].apply(year_from_name)
students
```
| | Name | Role | sex | year |
| --- | --- | --- | --- | --- |
| 0 | keeley | Student | F | 1998.147952 |
| 1 | john | Student | M | 1951.084937 |
| 2 | bryan | Student | M | 1983.565113 |
| ... | ... | ... | ... | ... |
| 276 | ernesto | Waitlist Student | M | 1981.439873 |
| 277 | athan | Waitlist Student | M | 2004.397863 |
| 278 | michael | Waitlist Student | M | 1971.179231 |
279 行 × 4 列
之后,绘制年份的分布情况很容易:
```py
sns.distplot(students['year'].dropna());
```
![](https://img.kancloud.cn/98/a6/98a6215abce7630fb0ec5f54ccbdd4c4_399x270.png)
为了计算平均年份:
```py
students['year'].mean()
# 1983.846741800525
```
这使得它看起来像是,学生平均是 35 岁。 这是一个大学本科课程,所以我们预计平均年龄在 20 岁左右。为什么我们的估计会如此之远?
作为数据科学家,我们经常遇到不符合我们预期的结果,并且必须做出判断,我们的结果是由我们的数据,我们的流程还是不正确的假设造成的。 不可能定义适用于所有情况的规则。 相反,我们将为你提供工具来重新检查数据分析的每一步,并告诉你如何使用它们。
在这种情况下,我们意想不到的结果,最可能是因为大多数名字都是旧的。 例如,在我们的数据记录中,约翰这个名字在整个历史中都相当流行,这意味着我们可能会猜测约翰出生于 1950 年左右。我们可以通过查看数据来确认:
```py
names = babynames.set_index('Name').sort_values('Year')
john = names.loc['john']
john[john['Sex'] == 'M'].plot('Year', 'Count');
```
![](https://img.kancloud.cn/bd/76/bd7676012b5f1e4e5b737637b527e45c_402x270.png)
如果我们相信,我们班没有人超过 40 岁或低于 10 岁(我们可以通过在课上观察我们的教室发现),我们可以通过仅检查 1978 年之间的数据,将其纳入我们的分析中。我们将很快讨论数据操作,并且你可能会重新分析这个示例,来确定纳入这一先验是否会提供更明智的结果。
- 一、数据科学的生命周期
- 二、数据生成
- 三、处理表格数据
- 四、数据清理
- 五、探索性数据分析
- 六、数据可视化
- Web 技术
- 超文本传输协议
- 处理文本
- python 字符串方法
- 正则表达式
- regex 和 python
- 关系数据库和 SQL
- 关系模型
- SQL
- SQL 连接
- 建模与估计
- 模型
- 损失函数
- 绝对损失和 Huber 损失
- 梯度下降与数值优化
- 使用程序最小化损失
- 梯度下降
- 凸性
- 随机梯度下降法
- 概率与泛化
- 随机变量
- 期望和方差
- 风险
- 线性模型
- 预测小费金额
- 用梯度下降拟合线性模型
- 多元线性回归
- 最小二乘-几何透视
- 线性回归案例研究
- 特征工程
- 沃尔玛数据集
- 预测冰淇淋评级
- 偏方差权衡
- 风险和损失最小化
- 模型偏差和方差
- 交叉验证
- 正规化
- 正则化直觉
- L2 正则化:岭回归
- L1 正则化:LASSO 回归
- 分类
- 概率回归
- Logistic 模型
- Logistic 模型的损失函数
- 使用逻辑回归
- 经验概率分布的近似
- 拟合 Logistic 模型
- 评估 Logistic 模型
- 多类分类
- 统计推断
- 假设检验和置信区间
- 置换检验
- 线性回归的自举(真系数的推断)
- 学生化自举
- P-HACKING
- 向量空间回顾
- 参考表
- Pandas
- Seaborn
- Matplotlib
- Scikit Learn