# 11.5 将Conda包作为依赖项发布给项目
**NOTE**:*此示例代码可以在 https://github.com/dev-cafe/cmake-cookbook/tree/v1.0/chapter-11/recipe-05 中找到。该示例在CMake 3.5版(或更高版本)中是有效的,并且已经在GNU/Linux、macOS和Windows上进行过测试。*
这个示例中,我们将基于之前示例的结果,并且为CMake项目准备一个更真实和复杂的Conda包,这将取决于DGEMM的函数实现,对于矩阵与矩阵的乘法,可以使用Intel的MKL库进行。Intel的MKL库可以以Conda包的形式提供。此示例将为我们提供一个工具集,用于准备和共享具有依赖关系的Conda包。
## 准备工作
对于这个示例,我们将使用与前一个示例中的Conda配置,和相同的文件命名和目录结构:
```shell
.
├── CMakeLists.txt
├── conda-recipe
│ └── meta.yaml
└── example.cpp
```
示例文件(`example.cpp`)将执行矩阵-矩阵乘法,并将MKL库返回的结果与“noddy”实现进行比较:
```c++
#include "mkl.h"
#include <cassert>
#include <cmath>
#include <iostream>
#include <random>
int main() {
// generate a uniform distribution of real number between -1.0 and 1.0
std::random_device rd;
std::mt19937 mt(rd());
std:: uniform_real_distribution < double > dist(-1.0, 1.0);
int m = 500;
int k = 1000;
int n = 2000;
double *A = (double *)mkl_malloc(m * k * sizeof(double), 64);
double *B = (double *)mkl_malloc(k * n * sizeof(double), 64);
double *C = (double *)mkl_malloc(m * n * sizeof(double), 64);
double * D = new double[m * n];
for (int i = 0; i < (m * k); i++) {
A[i] = dist(mt);
}
for (int i = 0; i < (k * n); i++) {
B[i] = dist(mt);
}
for (int i = 0; i < (m * n); i++) {
C[i] = 0.0;
}
double alpha = 1.0;
double beta = 0.0;
cblas_dgemm(CblasRowMajor,
CblasNoTrans,
CblasNoTrans,
m,
n,
k,
alpha,
A,
k,
B,
n,
beta,
C,
n);
// D_mn = A_mk B_kn
for (int r = 0; r < m; r++) {
for (int c = 0; c < n; c++) {
D[r * n + c] = 0.0;
for (int i = 0; i < k; i++) {
D[r * n + c] += A[r * k + i] * B[i * n + c];
}
}
}
// compare the two matrices
double r = 0.0;
for (int i = 0; i < (m * n); i++) {
r += std::pow(C[i] - D[i], 2.0);
}
assert (r < 1.0e-12 & & "ERROR: matrices C and D do not match");
mkl_free(A);
mkl_free(B);
mkl_free(C);
delete[] D;
std:: cout << "MKL DGEMM example worked!" << std:: endl;
return 0;`
}
```
我们还需要修改`meta.yaml`。然而,与上一个示例相比,唯一的变化是在依赖项中加入了`mkl-devel`:
```yaml
package:
name: conda-example-dgemm
version: "0.0.0"
source:
path: ../ # this can be changed to git-url
build:
number: 0
script:
- cmake -H. -Bbuild_conda -G "${CMAKE_GENERATOR}"
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=${PREFIX} # [not win]
- cmake -H. -Bbuild_conda -G "%CMAKE_GENERATOR%"
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX="%LIBRARY_PREFIX%" # [win]
- cmake - -build build_conda - -target install
requirements:
build:
- cmake >=3.5
- {{ compiler('cxx') }}
host:
- mkl - devel 2018
about:
home: http://www.example.com
license: MIT
summary: "Summary in here ..."
```
## 具体实施
1. `CMakeLists.txt`文件声明了最低版本、项目名称和支持的语言:
```cmake
cmake_minimum_required(VERSION 3.5 FATAL_ERROR)
project(recipe-05 LANGUAGES CXX)
set(CMAKE_CXX_STANDARD 11)
set(CMAKE_CXX_EXTENSIONS OFF)
set(CMAKE_CXX_STANDARD_REQUIRED ON)
```
2. 使用`example.cpp`构建`dgem-example`可执行目标:
```cmake
add_executable(dgemm-example "")
target_sources(dgemm-example
PRIVATE
example.cpp
)
```
3. 然后,需要找到通过`MKL-devel`安装的MKL库。我们准备了一个名为`IntelMKL`的`INTERFACE `库,该库可以用于其他目标,并将为依赖的目标设置包括目录、编译器选项和链接库。根据Intel的建议(https://software.intel.com/en-us/articles/intel-mml-link-line-advisor/ )进行设置。首先,设置编译器选项:
```cmake
add_library(IntelMKL INTERFACE)
target_compile_options(IntelMKL
INTERFACE
$<$<OR:$<CXX_COMPILER_ID:GNU>,$<CXX_COMPILER_ID:AppleClang>>:-m64>
)
```
4. 接下来,查找`mkl.h`头文件,并为`IntelMKL`目标设置`include`目录:
```cmake
find_path(_mkl_h
NAMES
mkl.h
HINTS
${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/include
)
target_include_directories(IntelMKL
INTERFACE
${_mkl_h}
)
message(STATUS "MKL header file FOUND: ${_mkl_h}")
```
5. 最后,为`IntelMKL`目标设置链接库:
```cmake
find_library(_mkl_libs
NAMES
mkl_rt
HINTS
${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/lib
)
message(STATUS "MKL single dynamic library FOUND: ${_mkl_libs}")
find_package(Threads QUIET)
target_link_libraries(IntelMKL
INTERFACE
${_mkl_libs}
$<$<OR:$<CXX_COMPILER_ID:GNU>,$<CXX_COMPILER_ID:AppleClang>>:Threads::Threads>
$<$<OR:$<CXX_COMPILER_ID:GNU>,$<CXX_COMPILER_ID:AppleClang>>:m>
)
```
6. 使用`cmake_print_properties`函数,打印`IntelMKL`目标的信息:
```cmake
include(CMakePrintHelpers)
cmake_print_properties(
TARGETS
IntelMKL
PROPERTIES
INTERFACE_COMPILE_OPTIONS
INTERFACE_INCLUDE_DIRECTORIES
INTERFACE_LINK_LIBRARIES
)
```
7. 将这些库连接到`dgem-example`:
```cmake
target_link_libraries(dgemm-example
PRIVATE
IntelMKL
)
```
8. `CMakeLists.txt`中定义了安装目标:
```cmake
install(
TARGETS
dgemm-example
DESTINATION
bin
)
```
9. 尝试构建包:
```shell
$ conda build conda-recipe
```
10. 过程中屏幕上将看到大量输出,但是一旦构建完成,就可以对包进行安装包。首先,在本地进行安装测试:
```shell
$ conda install --use-local conda-example-dgemm
```
11. 现在测试安装,打开一个新的终端(假设Anaconda处于激活状态),并输入:
```shell
$ dgemm-example
MKL DGEMM example worked!
```
12. 安装成功之后,再进行卸载:
```shell
$ conda remove conda-example-dgemm
```
## 工作原理
`meta.yaml `中的变化就是`mml-devel`依赖项。从CMake的角度来看,这里的挑战是定位Anaconda安装的MKL库。幸运的是,我们知道它位于`${CMAKE_INSTALL_PREFIX}`中。可以使用在线的`Intel MKL link line advisor`(https://software.intel.com/en-us/articles/intel-mml-link-line-advisor/) 查看如何根据选择的平台和编译器,将MKL链接到我们的项目中,我们会将此信息封装到`INTERFACE`库中。这个解决方案非常适合类MKL的情况:库不是由我们的项目或任何子项目创建的目标,但是它仍然需要以一种方式进行处理;也就是:设置编译器标志,包括目录和链接库。`INTERFACE`库是构建系统中的目标,但不创建任何构建输出(至少不会直接创建)。但由于它们是目标,我们可对它们的属性进行设置。这样与“实际”目标一样,可以安装、导出和导入。
首先,我们用`INTERFACE`属性声明一个名为`IntelMKL`的新库。然后,根据需要设置属性,并使用`INTERFACE`属性在目标上调用适当的CMake命令:
* target_compile_options:用于设置`INTERFACE_COMPILE_OPTIONS`。示例中,设置了`-m64`,不过这个标志只有GNU和AppleClange编译器能够识别。并且,我们使用生成器表达式来实现。
* target_include_directories:用于设置`INTERFACE_INCLUDE_DIRECTORIES`。使用`find_path`,可以在找到系统上的`mkl.h`头文件后设置这些参数。
* target_link_libraries:用于设置`INTERFACE_LINK_LIBRARIES`。我们决定链接动态库` libmkl_rt.so `,并用`find_library`搜索它。GNU或AppleClang编译器还需要将可执行文件链接到线程和数学库。同样,这些情况可以使用生成器表达式优雅地进行处理。
在`IntelMKL`目标上设置的属性后,可以通过`cmake_print_properties`命令将属性进行打印。最后,链接到`IntelMKL`目标,这将设置编译器标志,包括目录和链接库:
```cmake
target_link_libraries(dgemm-example
PRIVATE
IntelMKL
)
```
## 更多信息
Anaconda云上包含大量包。使用上述方法,可以为CMake项目构建依赖于其他Conda包的Conda包。这样,就可以探索软件功能的各种可能性,并与他人分享您的软件包!
- Introduction
- 前言
- 第0章 配置环境
- 0.1 获取代码
- 0.2 Docker镜像
- 0.3 安装必要的软件
- 0.4 测试环境
- 0.5 上报问题并提出改进建议
- 第1章 从可执行文件到库
- 1.1 将单个源文件编译为可执行文件
- 1.2 切换生成器
- 1.3 构建和链接静态库和动态库
- 1.4 用条件句控制编译
- 1.5 向用户显示选项
- 1.6 指定编译器
- 1.7 切换构建类型
- 1.8 设置编译器选项
- 1.9 为语言设定标准
- 1.10 使用控制流
- 第2章 检测环境
- 2.1 检测操作系统
- 2.2 处理与平台相关的源代码
- 2.3 处理与编译器相关的源代码
- 2.4 检测处理器体系结构
- 2.5 检测处理器指令集
- 2.6 为Eigen库使能向量化
- 第3章 检测外部库和程序
- 3.1 检测Python解释器
- 3.2 检测Python库
- 3.3 检测Python模块和包
- 3.4 检测BLAS和LAPACK数学库
- 3.5 检测OpenMP的并行环境
- 3.6 检测MPI的并行环境
- 3.7 检测Eigen库
- 3.8 检测Boost库
- 3.9 检测外部库:Ⅰ. 使用pkg-config
- 3.10 检测外部库:Ⅱ. 自定义find模块
- 第4章 创建和运行测试
- 4.1 创建一个简单的单元测试
- 4.2 使用Catch2库进行单元测试
- 4.3 使用Google Test库进行单元测试
- 4.4 使用Boost Test进行单元测试
- 4.5 使用动态分析来检测内存缺陷
- 4.6 预期测试失败
- 4.7 使用超时测试运行时间过长的测试
- 4.8 并行测试
- 4.9 运行测试子集
- 4.10 使用测试固件
- 第5章 配置时和构建时的操作
- 5.1 使用平台无关的文件操作
- 5.2 配置时运行自定义命令
- 5.3 构建时运行自定义命令:Ⅰ. 使用add_custom_command
- 5.4 构建时运行自定义命令:Ⅱ. 使用add_custom_target
- 5.5 构建时为特定目标运行自定义命令
- 5.6 探究编译和链接命令
- 5.7 探究编译器标志命令
- 5.8 探究可执行命令
- 5.9 使用生成器表达式微调配置和编译
- 第6章 生成源码
- 6.1 配置时生成源码
- 6.2 使用Python在配置时生成源码
- 6.3 构建时使用Python生成源码
- 6.4 记录项目版本信息以便报告
- 6.5 从文件中记录项目版本
- 6.6 配置时记录Git Hash值
- 6.7 构建时记录Git Hash值
- 第7章 构建项目
- 7.1 使用函数和宏重用代码
- 7.2 将CMake源代码分成模块
- 7.3 编写函数来测试和设置编译器标志
- 7.4 用指定参数定义函数或宏
- 7.5 重新定义函数和宏
- 7.6 使用废弃函数、宏和变量
- 7.7 add_subdirectory的限定范围
- 7.8 使用target_sources避免全局变量
- 7.9 组织Fortran项目
- 第8章 超级构建模式
- 8.1 使用超级构建模式
- 8.2 使用超级构建管理依赖项:Ⅰ.Boost库
- 8.3 使用超级构建管理依赖项:Ⅱ.FFTW库
- 8.4 使用超级构建管理依赖项:Ⅲ.Google Test框架
- 8.5 使用超级构建支持项目
- 第9章 语言混合项目
- 9.1 使用C/C++库构建Fortran项目
- 9.2 使用Fortran库构建C/C++项目
- 9.3 使用Cython构建C++和Python项目
- 9.4 使用Boost.Python构建C++和Python项目
- 9.5 使用pybind11构建C++和Python项目
- 9.6 使用Python CFFI混合C,C++,Fortran和Python
- 第10章 编写安装程序
- 10.1 安装项目
- 10.2 生成输出头文件
- 10.3 输出目标
- 10.4 安装超级构建
- 第11章 打包项目
- 11.1 生成源代码和二进制包
- 11.2 通过PyPI发布使用CMake/pybind11构建的C++/Python项目
- 11.3 通过PyPI发布使用CMake/CFFI构建C/Fortran/Python项目
- 11.4 以Conda包的形式发布一个简单的项目
- 11.5 将Conda包作为依赖项发布给项目
- 第12章 构建文档
- 12.1 使用Doxygen构建文档
- 12.2 使用Sphinx构建文档
- 12.3 结合Doxygen和Sphinx
- 第13章 选择生成器和交叉编译
- 13.1 使用CMake构建Visual Studio 2017项目
- 13.2 交叉编译hello world示例
- 13.3 使用OpenMP并行化交叉编译Windows二进制文件
- 第14章 测试面板
- 14.1 将测试部署到CDash
- 14.2 CDash显示测试覆盖率
- 14.3 使用AddressSanifier向CDash报告内存缺陷
- 14.4 使用ThreadSaniiser向CDash报告数据争用
- 第15章 使用CMake构建已有项目
- 15.1 如何开始迁移项目
- 15.2 生成文件并编写平台检查
- 15.3 检测所需的链接和依赖关系
- 15.4 复制编译标志
- 15.5 移植测试
- 15.6 移植安装目标
- 15.7 进一步迁移的措施
- 15.8 项目转换为CMake的常见问题
- 第16章 可能感兴趣的书
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